山医大二院薛金梅团队联合山医大-华大联合研究中心客座教授刘传宇团队发表鼻粘膜组织样本优化处理方案 助力单细胞多组学测序研究

来源:党委宣传部        作者:董瑞       编辑:王晔华(宣传部)       时间:2024/09/09 16:33:20       浏览次数:次

鼻粘膜作为呼吸道的重要屏障,承担着嗅觉、空气过滤和调节,以及宿主防御等多重功能。鼻粘膜组织中高度多样的细胞类型为实现这些复杂的生理功能提供了基础,但这些细胞类型在健康和疾病状态下的分子特征尚未得到完全解析。因此,利用高通量单细胞测序技术深入分析鼻粘膜样本的细胞功能状态,对于研究人员更好地理解鼻腔疾病的病理机制,推动诊断和治疗方法的进步具有重要意义。然而,如何同时获得高质量的鼻粘膜样本单细胞转录组学(scRNA-seq)和表观基因组学(scATAC-seq)数据,一直是研究人员面临的重大挑战。

近日,山西医科大学第二医院薛金梅团队联合华大生命科学研究院刘传宇团队在《STAR Protocols》上发表了一篇题为“Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data”的论文。该研究提出了一种优化的鼻粘膜样本处理方案,详细描述了从人类鼻粘膜组织中提取样本的步骤,包括机械和酶解离、红细胞裂解以及活性测定。研究团队还介绍了文库制备和质量控制的具体流程。这一方案的开发,旨在为鼻粘膜组织的单细胞转录组学和表观基因组学研究提供高质量的数据支持,有望为鼻腔疾病的深入研究提供重要的技术支持,推动相关领域的科学研究和临床应用的发展。

山西医科大学第二医院的薛金梅教授、华大生命科学研究院的刘传宇副研究员和殷建华副研究员为论文的共同通讯作者。山西医科大学-华大联合培养学生武毅莎、韩世锴,香港中文大学-华大联合培养博士生黄亚灵,以及西南大学-华大联合培养本科生王巧玲为论文的共同第一作者。本研究得到了山西医科大学-华大未来医学联合研究中心和深圳市单细胞组学重点实验室的支持。

初审初校:薛金梅

复审复校:王 红

终审终校:王 红

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